Kurs podatku VAT oraz podatków dochodowych w podmiotach medycznych 2026

Temat 1 – Podatek VAT w podmiotach medycznych (2 dni) – stare problemy nowe interpretacje

1. Krajowy System e-Faktur (KSeF) i jego zastosowanie w podmiocie medycznym.
   • Cel wprowadzenia i założenia.
   • Faktura ustrukturyzowana a faktura elektroniczna.

• Wystawienie, otrzymanie i przesłanie faktury ustrukturyzowanej.
  • Wysyłka faktur do KSeF – wykorzystanie programów finansowo – księgowych (API).
  • Data wystawienia, data przesłania i data otrzymania faktury ustrukturyzowanej – konsekwencje prawne i podatkowe stosowania nowej regulacji.
  • Funkcjonalności KSeF.
  • Wyznaczenie obligatoryjnego zakresu zastosowania.
  • Podział bazy klientów.
  • Zwolnienia z obowiązku stosowania faktury ustrukturyzowanej.
  • Przypadki udostępniania faktury poza KSeF.
  • Zasady pierwszego uwierzytelnienia się w systemie – uprawnienia właścicielskie.
  • Nadawanie uprawnień do wysyłki i odbioru faktur (token, ceryfikat autoryzujący).
  • Konto podatnika – możliwość tworzenia subkont dla członków grup VAT i jednostek samorządu terytorialnego (IdWew/GLN).
  • Funkcje pracowników w procesie stosowania KSeF.
  • MCU – Moduł Certyfikatów i Uprawnień.
  • Faktura offline24.
  • Faktura dla osoby fizycznej.
  • Faktura korygująca ustrukturyzowana.
  • Sankcje podatkowe za nieprawidłowe wystawienie faktury.
  • Struktura logiczna JPK-FA(3).
  • Wizualizacja faktury – kiedy obowiązek oznaczenia faktury kodem QR.
  • Korekty i rozliczenie korekt wynikających w faktur ustrukturyzowanych (zasady korekty podatku należnego i naliczonego – usunięcie not korygujących).
  • Awarie i niedostępność KSeF a fakturowanie i dodatkowe obowiązki.
  • Sankcje związane z nieprawidłowościami w stosowaniu KSeF.

1. Omówienie aktualnych schematów JPK w zakresie zgodności oznaczeń JPK z KSeF, symbole GTU i procedur z JPK na fakturach wystawianych przez podmiot medyczny.
   • Podstawa opodatkowania i podatek należny od poszczególnych rodzajów transakcji.
   • Dodatkowe kody/oznaczenia identyfikujące poszczególne dostawy i usługi (GTU – klasyfikacja z punktu widzenia sprzedawanych towarów i usług).
   • Dodatkowe kody/oznaczenia identyfikujące powiązania pomiędzy podatnikiem, a kontrahentami innymi niż jednostki budżetowe.
   • Faktura do paragonu (ujęcie w ewidencji VAT) oraz faktura uproszczona w nowym JPK_VAT.
   • Oznaczenia dowodów sprzedaży – kiedy podatnik ma je zastosować?
     • Dokument wewnętrzny.
     • Faktura do paragonu.
     • Dokument z kasy fiskalnej.
   • Dodatkowe oznaczenia/kody dowodów nabycia u podatnika.
2. Symbole PKWiU i kody CN oraz ich zastosowanie na fakturach wystawianych przez podmiot medyczny.
3. Faktury objęte mechanizmem podzielonej płatności.
4. Obowiązek podatkowy i podstawa opodatkowania przez podmiot medyczny – wybrane zagadnienia.
   • Usługi opieki medycznej.
   • Obligatoryjna metoda kasowa w służbie zdrowia – m.in. kserokopie dokumentacji medycznej dla Sądów.
   • Badania kliniczne – omówienie wyroku TSUE C-191/12 – zmiana linii orzeczniczej NSA
   • Usługi najmu i refaktura mediów.
   • Podstawa opodatkowania i jej korekty.
   • Świadczenia kompleksowe jednostki medycznej, a VAT.
   • Stawki VAT w działalności jednostki medycznej – nie zawsze zwolnienie.
5. Pozostałe kwestie dotyczące rozliczenia podatku VAT przez podmiot medyczny.
   • Odliczenie podatku naliczonego przez podmiot medyczny.
   • Odliczenie według struktury sprzedaży oraz korekty (sygnalizacja tzw. prewskaźnika).
   • Transakcje międzynarodowe (np. WNT, import i eksport usług, kwestia Brexitu) przez podmiot medyczny – wybrane problemy.
   • Zasady przeliczania kwot wyrażonych w walucie obcej.
   • Zakup produktów rolnych od rolnika ryczałtowego i faktura VAT RR.
   • Czynności nieodpłatne przez podmiot medyczny.
   • Zwolnienie podmiotowe przez podmiot medyczny – wskazanie takiej możliwości dla mniejszych placówek.
   • Biała lista i KUP.
   • Pre-współczynnik i współczynnik VAT w szpitalach.

Temat 2 – Podatek dochodowy w podmiotach medycznych (CIT, PIT – obowiązki Płatnika) (2 dni).

1. Podmiot medyczny jako podatnik podatku dochodowego od osób prawnych.
2. Przychody podmiotu medycznego i zasady ich ustalania.
   • Przychody należne w działalności medycznej w kontekście rozliczeń z NFZ (kontraktowe i ponadkontraktowe) – w tym ustalanie momentu powstania przychodu w przypadku przesunięcia rozliczeń w ramach limitu oraz nadwykonań.
   • Przychody należne z tytułu wykonania usług medycznych na zasadach komercyjnych.
   • Refaktura, a przychód.
   • Moment wykonania usługi.
     • Usługi wykonywane przez podmioty współpracujące – lekarzy, pielęgniarki, konsultantów, wolontariuszy itp.
     • Badania kliniczne, analizy, diagnostyka – przegląd interpretacji.
     • Rehabilitacja.
     • Ekspertyzy dla sądów i prokuratur.
     • Usługi szkoleniowe, (w tym współpraca z uczelniami w zakresie kształcenia).
     • Usługi reklamowe.
     • Usługi najmu oraz dzierżawy.
     • Usługi hotelowe i gastronomiczne.
   • Zasady rozliczania:
     • przychodów w naturze,
     • przychodów z tytułu nieodpłatnych świadczeń i świadczeń częściowo odpłatnych.
   • Zasady dokonywania korekty przychodów – w tym m.in. z tytułu:
     • błędów w wystawionych fakturach,
     • kwestionowania przez NFZ rozliczeń wykazanych przez podmiot medyczny świadczeń medycznych.
3. Koszty w działalności leczniczej.
   • Koszty uzyskania przychodów.
     • Kwalifikacja ogólna.
     • Celowość / dokumentowanie.
   • Podział na koszty bezpośrednie i pośrednie w działalności leczniczej.
   • Zasady potrącalności kosztów w czasie - koszty „bezpośrednie” i „pośrednie”.
   • Koszty rozliczane metodą kasową.
   • Jak określić, które z wydatków są, a które nie są powiązane z celami statutowymi?
   • Koszty podmiotów przekształcanych u następców prawnych.
   • Wydatkowanie środków na działalność statutową, a przekształcenie.
   • Korekta roczna podatku VAT w kosztach uzyskania przychodu.
   • Zasady ujmowania wierzytelności nieściągalnych w kosztach podatkowych.
   • Zasady dokumentowania kosztów.
   • Zasady korygowania kosztów w działalności leczniczej.
     • Termin uregulowania zapłaty za faktury dokumentujące wydatki zaliczane do kosztów bezpośrednich oraz pośrednich.
     • „Wyjście” towaru z magazynu, a brak zapłaty – konsekwencje w zakresie korekty kosztów.
     • Kontrowersje związane z momentem ujęcia korekty kosztów w rozliczeniach podatkowych podmiotu leczniczego – korekta „na bieżąco”, czy „wstecznie”?
     • Rozłożenie płatności na raty przez dostawcę, a konieczność korekty kosztów.
     • Regulowanie należności w kolejnych okresach rozliczeniowych skutkujące „kasowym” ujęciem kosztów - korzyści dla podmiotu leczniczego.
     • Brak zapłaty za faktury z tytułu nabycia bądź wytworzenia środka trwałego albo wartości niematerialnych i prawnych – obowiązkowa korekta w odniesieniu do amortyzacji.
4. Amortyzacja podatkowa składników majątku w podmiocie medycznym.
   • Kryteria zaliczenia składnika majątku do środków trwałych oraz wartości niematerialnych i prawnych.
   • Środki trwałe oraz wartości niematerialne i prawne nie podlegające amortyzacji podatkowej.
   • Zasady określania wartości początkowej - w tym m.in. otrzymanie przez podmiot medyczny sprzętu medycznego.
   • Ulepszenie środka trwałego – wpływ na wartość początkową oraz odpisy amortyzacyjne.
   • Przyłączenie oraz odłączenie części składowych i części peryferyjnych – wpływ na wysokość odpisów amortyzacyjnych.
   • Metody oraz stawki amortyzacji.
   • Straty w środkach trwałych oraz likwidacja środka trwałego, w tym inwestycji w obcym środku trwałym.
   • Zaniechane inwestycje.
   • Leasing środków trwałych oraz wartości niematerialnych i prawnych.
   • Środki trwałe sfinansowane z dotacji UE – zasady ich rozliczania przez podmiot leczniczy.
5. Zasady sporządzania deklaracji podatkowych CIT-8 przez podmioty medyczne.
   • Znaczenie przychodów i kosztów bilansowych.
   • Przychody zwolnione z opodatkowania.
   • Przychody niepodlegające opodatkowaniu.
   • Przychody podlegające opodatkowaniu w roku bieżącym, ujęte w księgach rachunkowych lat ubiegłych.
   • Dochody wolne od podatku.
   • Koszty niestanowiące kosztów uzyskania przychodu.
   • Koszty lat ubiegłych.
   • Korekty przychodów i kosztów.
   • Kalkulacja podatku.
6. Podatek u źródła (WHT).
7. Koszty pracownicze/obowiązki płatnika.
8. Zagadnienia wybrane
   • Podatek minimalny – wyłączenia dla spółek medycznych.
   • Ulga na złe długi.
   • Płatności bezgotówkowe/split payment/biała lista.
   • Raportowanie schematów podatkowych w podmiotach z branży medycznej.
   • Obowiązki sprawozdawcze i informacyjne w podmiotach medycznych.
   • Przesyłanie ksiąg i ewidencji w zakresie CIT – JPK_KR.
   • Struktura JPK_KR-PD (jakie informacje obowiązkowo za okres od 1.01.2025 a jakie za okres od 1.01.2026).
9. Test walidacyjny

Link to testu online zostanie wysłany po zakończonych zajęciach. Test przygotowała osoba prowadząca walidację niniejszego kursu. Test zawiera pytania do których należy wybrać jedną odpowiedź spośród trzech propozycji. Wynik testu jest automatycznie wyliczany w pliku google.

Po uzyskaniu wyniku pozytywnego, Uczestnik otrzyma zaświadczenie o ukończeniu kursu. 

Usługa jest realizowana w godzinach dydaktycznych 45 minut. Każdego dnia zaplanowano przerwy: 10:30-10:45, a później 12:30-13:00.

Przerwy nie wliczają się w liczbę godzin usługi (7 x 45 minut dydaktycznych + 45 minut przerwy).

Każdy temat realizowany jest w trybie 5 godzin zajęć teoretycznych i 2 godziny zajęć praktycznych.

Na kurs zapraszamy w szczególności:

• pracowników działów finansowo-księgowych w podmiotach medycznych,
• osoby, które zajmują się rozliczaniem podatków w podmiotach z branży medycznej,
• kierowników placówek medycznych,
• specjalistów ds. podatkowych obsługujących jednostki sektora ochrony zdrowia,
• osoby, które chcą poszerzyć swoją wiedzę na temat podatków w kontekście działalności medycznej.

Kurs przeprowadzany będzie w formie online, bez podziału na grupy. Uczestnicy mają możliwość korzystania zarówno z kamerki jak i mikrofonu. Taką chęć mogą zgłaszać na bieżąco poprzez kliknięcie ikonki „dłoń”. Pytania można również zadawać za pomocą czatu.

Uczestnik usługi otrzyma komplet materiałów szkoleniowych w formie PDF, przygotowany przez prowadzących:

- skrypt

- dostęp do nagrania szkolenia na okres 21 dni. 

Cena bez VAT dla opłacających szkolenie, w co najmniej 70% ze środków publicznych.

Do współpracy zaprosiliśmy najlepszych ekspertów. Jeśli chcesz by Twoja praca w przyszłości była o wiele prostsza, łatwiejsza i przyjemniejsza, pomożemy Ci w tym. Zapraszamy Cię serdecznie na nasz kurs.

Zapraszamy do odwiedzenia naszej strony internetowej: https://wektorwiedzy.pl/

Link to testu online zostanie wysłany po zakończonych zajęciach. Test przygotowała osoba prowadząca walidację niniejszego kursu. Test zawiera pytania do których należy wybrać jedną odpowiedź spośród trzech propozycji. Wynik testu jest automatycznie wyliczany w pliku google. Link do testu ważny jest 7 dni od daty zakończenia kursu.

Po uzyskaniu wyniku pozytywnego, Uczestnik otrzyma zaświadczenie o ukończeniu kursu. 

Szkolenie bedzie prowadzone za pośrednictwem Platformy ClickMeeting. 

Szkolenia na ClickMeeting nie wymagają instalowania żadnego programu, są transmitowane przez przeglądarkę. Bardzo ważne jest, żeby była ona zaktualizowana do najnowszej wersji (jeśli nie będzie aktualna, podczas testu nie pojawi się zielony “✓”). W razie potrzeby istnieje też możliwość pobrania aplikacji mobilnej i uczestniczenia w szkoleniu poprzez smartfon lub tablet.

Wymagania techniczne: procesor 2-rdzeniowy 2 GHz; 2 GB pamięci RAM; system operacyjny Windows 8 lub nowszy, MAC OS wersja 10.13; przeglądarka internetowa Google Chrome, Mozilla Firefox lub Safari; stałe łącze internetowe o prędkości 1,5 Mbps.

Najbezpieczniejszą opcją jest połączenie internetowe za pomocą kabla sieciowego. Gdy nie ma takiej możliwości i pozostaje korzystanie z WiFi, warto na czas szkolenia umieścić komputer jak najbliżej routera i zadbać, aby inni użytkownicy tej samej sieci WiFi ograniczyli w tym czasie aktywności mocno obciążające sieć (np. oglądanie filmów, rozmowy wideo lub pobieranie dużych plików). Jeśli jest taka możliwość zachęcamy do przetestowania połączenia w domu oraz miejscu pracy i uczestniczenia w szkoleniu z tego miejsca, w którym będzie lepszy Internet.

Jak dołączyć do spotkania: https://youtu.be/ZFWhNh2KHro, https://knowledge.clickmeeting.com/pl/infographic/jak-dolaczyc-do-wydarzenia-instrukcja-dla-uczestnika/

Link umożliwiający uczestnictwo w kursie ważny jest od dnia poprzedzającego rozpoczęcie kursu do zakończenia zajęć.

Podstawą do rozliczenia usługi, jest wygenerowanie z systemu raportu, umożliwiającego identyfikację wszystkich uczestników oraz zastosowanego narzędzia.